有一天清晨，司農少卿王曉來拜訪他，當時林機在都察院還沒有回來，林機的夫人，也就是王曉的姪女，流著眼淚對王曉哭訴：“林家快要滅門了！”王曉很驚訝的問她原因。

林夫人說：“天快亮的時候，我夢見一紅衣人，手上拿著天符跟我說：天帝有命，‘林機議論國事時傷害百姓，特令要讓林氏滅門。’我因驚嚇就醒過來了！但是這個夢仿佛還在眼前呢！”

王曉用夢沒有根據來安慰林夫人，勸其不必悲傷擔憂。林夫人留王曉用餐，等林機回來。

待林機返家，王曉從容的問他近來上奏的內容。林機回答說：“四川旱災，沒有收成，有官吏奏請皇上撥十萬石的米去救濟賑災，皇帝有旨準奏了。我認為十萬石米數量太多，蜀道又非常難走，應當核實清楚後再給糧米，所以我封還聖旨，沒有下達皇帝的命令給四川救濟糧。皇上諭令宰相說：‘此地至四川往返萬里，如果等待查報核實，恐怕於事無補了，先給一半的糧吧’。只有這一件事。”

王曉聽了之後，皺著眉頭離去。

沒多久，林機就因為生病回歸故里，才走到福州就去世了，他的三個兒子也相繼病死，子嗣斷絕，沒有後代。