他後來擔任省裏的官員。當時贛州劉貴造反。元明善的士兵捉住了三百名叛賊。元明善從輕處罰，使一百三十人免於死刑。有一天，元明善手下的將領說：應該多殺俘獲的叛賊。死了的應戮屍示眾，以振軍威。元明善力爭：王者之師，恭敬地尊行天意處罰。叛賊是小丑跳梁，殺其魁首即可。百姓何其無辜。不久官府得到叛賊所寫的贛、吉兩地十萬百姓的名冊。有司（地方官）竊喜，打算牽連更多人，從中邀功謀利。元明善請求燒掉反叛者的名冊。於是，兩個郡的百姓得到安寧。

元仁宗時，元明善奉旨到山東、河南賑飢。當時彭城、下邳各州連著幾十個驛站，人餓馬死，而官府未下達賑飢貸糧的文書。元明善就把一萬二千錠的鈔票分給百姓（註﹕中華古代，在元朝時就有紙幣了），並說：我擅自下令（發放賑災款），就是被上級問罪也不推辭。元朝皇帝沒有對元明善問罪，而是對他很禮遇。

在中華古代，要想有官祿、仕途，首先要有好的人品。行善有德，官祿、仕途自然就有了。

註﹕元仁宗，名叫愛育黎拔力八達。

（《元史 卷一百八十一 列傳第六十八》）