例如：博州刺史、琅邪王李衝，派遣僕人收取利息，認識了顏余慶，僕人自己買弓箭回去了。李衝被以謀反罪處死，顏余慶被誣告和李衝一起謀反。徐有功拿出永昌年間的赦令，在殿上力爭，顏余慶得免死。當時，在殿上的朝臣、衛士幾百人，都縮起脖子，不敢呼吸，只有徐有功鎮定安詳，屹立不屈。

又例如：有個叫「韓紀孝」的人，接受了造反的徐敬業授予的偽官，在徐敬業失敗前已經死去。判官派顧仲琰籍沒其家，聖旨已經批准。徐有功覆議說：「法律規定，謀反者斬。身亡則沒有斬的法律，沒有斬的法律就不得株連。」聖旨改成赦免。如此獲寬宥的有數十、上百家。

侍郎（官名）任知古、尚書（官名）裴行本等七人，被構陷，面臨死刑。主政者對公卿說：「古人以殺止殺，我如今以恩止殺。各位為任知古等人求情，我賜他們再生，各自都授予官職。」來俊臣、張知默卻違抗聖旨，請求用重法處死。徐有功反駁說：「來俊臣違背明主的再生之賜，損害了聖人的恩信之道。臣子事奉君主一定要順應君主的美意。」裴行本竟因此免死。

道州刺史李仁褒兄弟，被唐奉一構陷，被判死刑。徐有功為他倆辯護，未能成功，反而被周興參奏：「兩漢的法律，附下瞞上的腰斬，當面欺君的人也斬。斷章取義破壞法律的人殺。徐有功故意出脫謀反的囚犯，罪當不赦。應治他的罪。」徐有功被罷官，但當他再次被啟用時，仍為他人力爭、申冤。

潤州刺史竇孝諶的妻子──龐氏被僕人誣告，說她夜裏詛咒。給事中（職務名）薛季昶誣判龐氏死罪。徐有功獨自申明龐氏無罪。薛季昶反而誣陷說徐有功是龐氏的同黨，說他援救叛逆，判決徐有功斬首棄市。徐有功正在辦公，令史流著淚把判決告訴他。徐有功聽後，說：「難道只是我一個人會死，而眾人永遠不死嗎？」從容地走了。主政者看了處決徐有功的奏章，問徐有功：「你斷案，重罪輕罰的為甚麼這麼多？」徐有功答：「重罪輕罰是臣下的小過；好生，是聖上的大德。願陛下弘揚好生的大德，則天下幸甚。」主政者默然。於是，龐氏減刑免死，徐有功付出了罷官為平民的代價。徐有功的善行得到了善報。後來，竇孝諶的兒子──竇希瑊等人，請求把自身的官爵，讓給徐有功的兒子──徐子惀，來報舊恩。

不久，徐有功又被起用、升官。徐有功對親近的人說：「如今身為司法官，人命所懸，一定不能順從上級的旨意和詭辭，以求苟活。」故而，他前後做獄官，因為諫阻枉殺，而三次差點被問死罪，但他執志不渝，酷吏因此勢稍衰。有人說：「若獄官都是這樣，用不上刑法的日子怎麼會遠呢？」

（《舊唐書》《新唐書》）