一九九九年大法遭到污衊，余桂芝和許多法輪功學員去北京上訪，回來後，她丈夫相信了警察的話，和她一起到政法委、公安局去銷號，誰知一去，她就被關押了。到晚上她丈夫要接她回家，政保科的陳亞東、陳新運等人說不行，說是她在家搞集會，所以當地走了幾十人到北京上訪。她丈夫就找人去說情，後罰款兩千元，才放她回家了。

在九九年十二月六日早上，公安局又打電話叫余桂芝去問個事，結果被吳子橋煙店調上來的警察吳某（上海口音）劫持到四里看守所，非法關押五十天，還被迫交750元生活費。

二零零零年十一月七日早上，余桂芝正在家做事，又被公安局陳亞東、陳旭東（女）、實習生楊某、聶兵等人綁架到公安局，非法關押三天三夜，不許睡覺，要她交出當地資料點和與哪些人來往。警察實在問不出甚麼才放她回家。

二零零一年三月，當地在河西第二看守所辦洗腦班，綁架關押了余桂芝等二十多個法輪功學員。當地「610」頭目李綿楚，政法委陳光德、丁玲麗、宣傳部張斌、律師廖文、財政局吳建國等許多單位都調人去了。在洗腦班裏，余桂芝成了李綿楚、張斌的眼中釘。張斌曾煽動一位法輪功學員的丈夫打余桂芝兩個耳光，把她的嘴打出血了，臉也腫起來了。而「610」相關人員李綿楚、陳光德、張斌等人看著卻哈哈大笑。余桂芝在洗腦班被關押了70多天，「610」頭目李綿楚逼她丈夫去「轉化」她，她丈夫的單位也不許她丈夫上班，說甚麼時候「轉化」其妻才來上班。她的丈夫說這個做不到，這是信仰問題，這樣她的丈夫就一直在家呆到她從洗腦班出來才上班。洗腦班最後還勒索了余桂芝三千多元錢。

二零零一年七月九日晚上，公安局陳新運、李凌等人半夜兩點多鐘闖到余桂芝家敲門，見她不開門，他們就翻院牆，把門撞開後非法抄家，但甚麼也沒抄到，就把余桂芝綁架到公安局院，又關了兩天兩夜，其間惡徒打罵不休。並在第三天晚上把劫持到四里看守所，非法關押16天。這次她丈夫為救她，請客吃飯花了一千多元。

二零零一年九月二十六日上午，公安局沈超、陳旭東、陳洪等人又闖到余桂芝家非法抄家，也是甚麼都沒抄著，同樣又把她綁架到當地國稅局關押了三天三夜。晚上用手銬銬著不許睡覺，開空調凍她。她多次質問警察動不動就關押是甚麼意思。沈超大罵：「老子這一次叫你站著進去躺著出來。」到了第三天晚上，要把她送往外地，她當時一頭撞到一個空調架子上，流了很多血，當時被送醫院搶救。自此余桂芝一直絕食，在看守所裏隔一天就被灌食一次，灌的她胃出血，不斷吐血。當時在場的人嚇壞了，一副所長說這樣會出人命的。余桂芝丈夫和她大女兒天天到公安局要求放人。公安局的柯繼成嘴上總是往上推，實際上把她三次送勞教，勞教所不收。余桂芝的丈夫非常氣憤，找到沈超、柯繼成說：「聽說她這段時間一直沒有吃，她要是在裏面有個三長兩短，就把她抬到市政府大門口，抬到公安局門口，叫眾人評論一下你們是甚麼人，而且叫她娘家人都來你們公安局住著。」警察到第二十八天只好放人。在放她時，看守所還要她丈夫交灌食費600元、營養費300元。她丈夫當時看到她瘦的不像人樣，含著淚交了錢。

在二零零一年十二月十四日，國保警察陳新運、李凌看見余桂芝在市政府旁邊她女兒的服裝店裏幫忙，倆人就跑到她女兒店裏問資料點在哪裏，誰是負責人，誰在打印資料。她女兒說一概不知，這時正好余桂芝的丈夫下班來到這裏，一看又是他們兩個，就跟他們吵了起來。李凌還想動手，誰知下班人多，她丈夫就跟他們大吵大鬧的，一直鬧到市政府門房，這時圍觀的人很多，問為甚麼。她丈夫就講妻子是煉法輪功的，上月被他們關押了二十八天差點餓死，剛回來不久，現在做做生意，他們又想迫害她，現在就跟他們拼了。結果眾人都說他們倆沒有道理，陳新運、李凌見勢不利，趕快灰溜溜地騎著摩托車走了。

二零零五年七月九日晚上七點多鐘，公安局警察楊北平帶了十幾人又到余桂芝家非法抄家。說是她家有《九評共產黨》書籍等，余桂芝的丈夫和兩個女兒知道此事後就急忙趕回家，質問他們又要幹甚麼，不說出所以然來就跟他們沒完。楊北平支吾說他和她丈夫是同學，來看看同學。她大女兒說這叫看同學嗎？她丈夫對他們說扯淡，誰跟他是同學，說假話都不打草稿，把他們說得無話回答。楊北平找下台階說他們也沒有辦法，是上頭要他們來的，他們只是走一下過場。樓上樓下看了一下，沒抄到甚麼就走了。

二零一零年十二月十六日上午，余桂芝又被外地公安局警察綁架。在當地公安局、刑警隊、東城派出所的配合下，把她綁架到江蘇無錫看守所關押，在那裏關押了兩個月後，將她非法勞教一年。