李亞洲在古塔公安分局任職期間，就積極參與迫害法輪功學員。錦州石化公司職工王舟山到公園煉功，被非法判拘留十五天後，石油派出所警察非法將其劫持到派出所，找來錦州電視台人員，古塔公安分局李亞洲等人聯合對其製作攻擊大法的錄音稿，因王舟山實話實說，講真相，錄音被迫停止。他們又找家屬及單位領導施壓，半天後，才將其放回。

從二零零六年李亞洲任錦州公安局副局長，主管迫害法輪功以來，李亞洲是錦州市警察系統直接參與迫害法輪功的最高邪黨官員之一。錦州地區發生多次大規模的迫害案例，負有相應領導責任。他的言行、指示（包括口頭指示）對下面官員的影響很大，而他本人也一直在參與迫害，錦州各個基層警察、市反××協會、市維穩辦（「六一零」）每次對法輪功學員的迫害，都要請示李亞洲，他的態度左右著下屬人員的行為。近年來的一些迫害案例都是在他的指示下發生的。他親自簽署對法輪功學員的通緝令；指示基層警察「嚴打」法輪功學員；部署對法輪功學員的非法拘留、勞教、起訴等。

李亞洲對待法輪功學員採用了為世人所不齒的特務流氓手段，雇佣社會閒散無業人員以物質利益的誘惑，蹲坑、跟蹤法輪功學員；並利用監聽、監控手段，設專人查詢法輪功學員的通話信息，隨時能查出通話聯繫人，而且有針對性的對特殊電話群體進行監控，侵犯公民的最基本的合法權利。同時成立「法輪功人員信息表」、建立數據庫，照片、個人信息等一應俱全，為迫害作準備。

從二零零八年以來，錦州發生多起同一時間有預謀的大規模綁架事件，這些綁架案中的人數少則十幾人，多的則有三十餘人。對綁架的學員進行酷刑折磨，這些被綁架的學員許多被羅織罪名後被非法勞教、判刑，甚至是重刑。

法輪功學員宋亞萍，女，四十多歲，二零零九年四月十七日早六點四十分，在兒童公園北門被惡警們綁架。她被打得頭暈、噁心、嘔吐不止，被送看守所時，看守所拒收。隨後，宋亞萍被送到醫院檢查，發現腹中還有瘤子，李亞洲知道情況後，強制看守所必須把人收下，「死了算正常死亡」 。

而在綁架法輪功學員的同時，對法輪功學員家的財物大肆搶劫，連私家的車輛都被作為作案工具開走，這些惡警不僅搶劫財物，還利用家屬急盼親人回家的心理，勒索錢財。僅二零一二年下半年以來，多名法輪功學員家屬被以各種方式勒索了巨額錢款，據不完全統計已達一百五十多萬元之巨。警察公然叫囂「拿十萬元、把別人咬出來、寫保證就回家」。

然而，人算不如天算，在李亞洲的工作調整為分管治安的副局長不久，就發生了世園會喊口號事件，因此被免職，這也是上天的慈悲，對李亞洲的一次警告，如果還不棄惡從善，更大的惡報在等著他。