在中共邪黨迫害法輪功後，二零零零年十月馬永菊依法去北京上訪，被強制押回後被拘留了十五天，並且從她丈夫的工資中扣除了去接她們的人的差旅費，二零零二年馬永菊因散發真相資料被非法勞教三年。在那三年中，她承受了巨大的精神和肉體的折磨。 二零零九年馬永菊又被非法勞教，下面是她被迫害經過。

二零零九年馬永菊和另一呂姓法輪功學員在牆上寫「法輪大法好」被惡警包圍，因當時呂懷有身孕，馬永菊怕她被迫害，就承擔了全部責任。但在邪黨的邪惡機制下，呂姓學員依然被強行墮胎，並以監外執行的形式被勞教一年。馬永菊先是被拘留十五天，並被鐘山分局國保大隊的一名年輕惡警用雙拳猛擊頭部，像打鼓一樣。

非法拘留期滿後，家屬去接人時得到通知馬永菊已經被勞教一年。馬永菊拒不在勞教決定書上簽字，但依然被非法強制送往清鎮市中八女子勞教所勞教。

馬永菊這一年遭受的迫害最是嚴重，先是「熬鷹」即不讓睡覺，一直站著直到小腿萎縮。惡警袁芳指使包夾把毒藥下在馬的飯裏，馬永菊三次劇烈的嘔吐。邪惡在下毒時一個有良知的包夾總是暗示馬今天不要吃飯或今天不要吃菜，一次馬在飯中發現沒有捻碎的半片黃色藥片，不知是甚麼藥。惡警袁芳為了升遷，不惜一切手段迫害大法弟子，結果官沒當上，自己出了車禍，把臉擦傷。並且袁芳的兒子還吸毒。惡警袁芳和惡警顧新英指使包夾限制大法弟子上廁所，在二十四小時以內只能去一次廁所。馬永菊來月經時，既不讓上廁所，也不讓用衛生紙，血水順著褲子淌。並且每天都不讓吃飽飯，馬永菊的丈夫給她寄了兩千元錢，袁芳不讓她用致使她長期飢餓。還得日夜站著，馬永菊虛弱到看任何東西都天旋地轉，這種狀況持續了半年。

快出勞教所時，鐘山區國保大隊人員和一幹部去勞教所「看」馬永菊，問：「你出去以後還煉不煉法輪功？」馬說這麼好的功法，我出去以後肯定要煉的。那個幹部大喊一聲：「好！我就喜歡這樣的人，敢作敢當，怎麼想就怎麼說。我最討厭畏畏縮縮，口是心非的人。」