中共瘋狂地迫害法輪功，她很不理解，法輪功多好哇，教人按「真善忍」做好人，既能使人身體健康，又能為國家節約不少醫藥費等等，怎麼不讓煉了給取締了呢？這樣在2000年底，她去北京上訪，到了天安門廣場，喊「法輪大法好，法輪大法是正法、還師父清白」，被北京警察抓捕，後走脫了。第二天，還沒找到上訪的地方，在北京天安門金水橋，喊「法輪大法好」時，被多名警察攔住，用膠棍打她頭部。

有一警察狠狠地一拳打在她的太陽穴上，把她的眼鏡打碎掉在地上。她離了眼鏡甚麼也看不見，就喊：我的眼鏡呢？一警察從地上撿起眼鏡照著她的前額投來，打在她右眼眉的上方，鮮血瞬時流了下來，現在還留下一傷痕，而後強行把她推上車，帶到德州駐京辦事處。

2001年元旦，由單位領導家屬隨同拉回本單位，元月2日武秀雲就被關進德州市看守所，每天5個小黑窩窩頭，沒有菜，白菜根子的半勺菜湯，一個星期一丁點鹹菜。在看守所關押一個月，扣伙食費4百元，敲詐家人5000元錢後，於2月2日放回家。回家後，也沒過上消停日子，不斷地來人騷擾她的正常生活。

2001年7月20日，武秀雲在家伺候有病的公公，突然撞進七、八個人是河西派出所的警察，非法抄家，搶走大法書籍和師父法像等，又把她關進市看守所一個月，扣4百元伙食費。這一次，嚇的武秀雲的公公病情加重。

2001年的11月初，她家來了遠方親屬，突然河西派出所的一個姓王的人員帶著搜查證到她家亂翻一氣，翻出20多份資料，逼迫她說出是誰給的，並叫來車，把她綁架到看守所，非法關押20天。早上剛吃過飯，德城區公安分局劉大衛等人來到看守所，把她送濟南勞教一年。在查體時，肝臟有病，勞教所不收。劉大衛上下樓跑了好幾趟，勞教所還是不收。劉大衛又預謀把她送本市洗腦班，武秀雲單位領導不同意，劉才肯放了武秀雲。

2008年5月13日，突然河西派出所國安季大隊長帶著七、八個人撞進武秀雲家，說有人舉報，抄家時抄出一支筆，說是她在廠公園書寫標語，法輪大法好，武秀雲對圍觀的群眾講法輪功好，這是真理，並講她過去的身體狀況，警察們不讓她說。他們又從武的家中翻出大法書，因此就定了武的罪，把她帶到派出所，逼迫她說資料是哪來的，武不說，惡警們又把她送到德州市看守所。看守所人員一看，她歲數大並有乙肝病，拒收。季隊長急了，又把她帶到139醫院，叫他們給查肝功，醫院說吃了飯不能查。季大隊長又找人（後門）查，武當時沒帶錢，又逼她找住院的病號借的錢才查的，顯示病情嚴重，國保警察這才不得不放她，但逼迫她交3千元取保費。武家沒錢拒交。