中共迫害法輪功由公開轉入地下，有多方面原因。首先是中共公開迫害搞不下去了。二零零一年，江澤民、羅幹集團策劃和導演了「天安門自焚」，試圖栽贓陷害法輪功，一時確實矇騙了許多人，使得迫害升級。不過「天安門自焚」是個雙面劍，可以矇騙不明真相的人，但紙包不住火，有分析指出，這個「自焚」偽案漏洞百出，完全是栽贓誣陷，又讓許多人看清迫害的邪惡和血腥，讓許多人明白了真相，給中共江氏集團巨大的打擊。

法輪功學員的大力揭露迫害，和反迫害力度越來越大，使得迫害從「自焚」偽案後的高峰下跌，讓中共騎虎難下，大概從二零零三年開始，轉而採取「外鬆內緊」的方針，於是迫害逐漸由公開轉入地下，中共內部稱之為「看不見硝煙的戰爭」。

迫害法輪功由公開轉入地下，中共試圖來掩蓋迫害，轉移人們的注意力。中共打擊法輪功從開始就沒有任何法律依據，不僅按照西方的憲政精神是非法的，就是按照中共自己的法律，都沒有任何法律依據，純粹是「以權代法」。中共的如意算盤是要「三個月消滅法輪功」，但是多少個三個月過去了，中共對法輪功仍然無能為力，因此不敢讓各界長期關注法輪功問題，那樣的話，很多人就會站起來反對迫害了。

迫害轉入地下後，中共又以此來矇騙各界，說迫害取得了「勝利」，說法輪功被完全打下去了，說法輪功在中國沒有了等等，以轉移國際社會對其人權問題的關注。

中共迫害法輪功由公開轉入地下，也使得迫害變得更加隱秘。中共一方面毫不放鬆地迫害，但又害怕人們知道真相，想讓人淡忘，逃避自己欠下的血債。另一方面，就是大力粉飾太平，以欺騙的方式讓不明真相的人對其抱著幻想，以苟延殘喘。

許多有識之士都看到，中共對法輪功不計後果的迫害，已經無法收場，早就出現敗象。現在中共仍然把法輪功作為「頭號敵人」，但是沒有能力動搖法輪功，在國外法輪功的聲勢越來越大，已經傳到一百一十多個國家；在中國大陸，數千萬法輪功學員在腥風血雨中堅定不移，完全超出中共迫害者的預料與想像。

中共對法輪功的迫害，從當初的鋪天蓋地，到現在被迫轉入地下，也反映出在善惡的較量中，中共惡的力量越來越弱，法輪功學員反迫害聲勢越來越大，法輪功在世界各地傳得越來越廣，法輪功真相越來越深入人心，越來越多的正義之士支持法輪功。

由於其本性所致，中共只要存在一天，就不會主動停止迫害。但是，中共迫害由公開轉入地下，說明迫害已經失敗。