99年4月，科痞何祚庥在天津《青少年科技博覽》雜誌發表文章誣蔑法輪功，法輪功學員到雜誌編輯部澄清事實真象，4月23日、24日，遭天津警察暴力毆打，導致學員流血受傷，並非法抓捕45名法輪功學員。李小妹去了天津也被抓了。北京站的負責人和其他部份法輪功學員到公安部交涉，要求立即釋放在天津被抓的法輪功學員。公安部的人矢口否認天津公安局抓人，雙方正在交涉中，北京站的一個學員的手機響了，是李小妹打來的，李小妹告訴他自己剛從天津公安局放出來，這時公安部的人在事實面前啞口無言。

從天津事情發生以後，李小妹就幾乎與同修失去聯繫，手機電話被監控，人被跟蹤。她不敢與家人同住，因她家裏放著大量的大法書籍，為了保護大法書，她單身住了一個地方。

99年4.25以後，惡人要對她下毒手找理由，企圖製造車禍陷害她，在她的汽車輪胎裏塞進了報紙，被她及時發現，惡人陰謀沒得逞。大約在99年六月份左右，不法人員在沒有證據的情況下，將她強行抓捕。抓她的那天晚上，她住處的樓道上站滿了兩排武警，戒備森嚴，被抓時她穿著睡衣。惡警在北京香山賓館租了十幾個套間，把她一人關在那裏，進行24小時監控，連翻個身都要作記錄。她被抓連她家人都不知道。她當時感到自己處境很危險，見不到一個外人，即使被迫害死也無人知道。她說，惡人還強行要她拍錄像，她知道他們想利用她造假，迷惑學員，迷惑世人，所以她堅決抵制。不知在那裏關了多久，又把她送到北京七處非法關押，等到2000年元月中旬又把她轉到東城區看守所。

在看守所，她看到了來自全國各地在天安門打橫幅講真象的大法弟子，很高興，了解了大法形勢，全國各地大法同修前赴後繼出來證實法，她更堅定了信心。後來她被非法判了七年，她姐姐李小兵被判了六年。

沒過幾天，因我們七個大法弟子集體煉功（其中有錦州大法弟子王文君也在，被迫害致死），女惡警全副武裝，氣勢洶洶對大法弟子長時間體罰，後來我們被強行分開，以後再也無法打聽到李小妹的消息。