2002年7月她被學院送入在株洲白馬壟勞教所旁設立的一個特殊的洗腦班。期間，惡徒們叫株洲白馬壟勞教所的猶大和惡警對她進行迫害，整天整天的強迫她看誣蔑大法的錄像，如果稍一閉眼，就被罰站或被人用手掐眼皮；這中間，她曾走脫，但不久在火車站被惡人找到，又被綁架到招待所內，對她拳打腳踢和捆綁。一個月下來，她依然十分堅定。學院把她從株洲又送回了長沙市芙蓉區610洗腦班。
由於她堅定修煉，2002年10月初，被所在單位主動送到白馬壟勞教所，非法勞教一年（後加期）。其單位還跟勞教所講：「不管你們用甚麼辦法，也要讓她轉化！」 在勞教所，何應清因堅修大法、不接受邪惡的安排而受盡折磨。白馬壟勞教所惡警見何堅持煉功，對她採取了不讓睡覺、不准上廁所、罰站等體罰手段和人身摧殘，每天除19：00-22：00讓她睡覺外，其它時間都被罰站；不讓上廁所，或規定每天四次左右上廁所時間，此種體罰一直延續了60多天。到後來，只許何應清睡三、四個小時，何應清還得承受值班人員的謾罵、污辱和害人不見傷的陰毒手段折磨。
她曾在白馬壟勞教所組建的「攻堅隊」（專門迫害堅定學員的洗腦隊）被銬40天，除吃飯外，每天被上銬20多個小時，惡警不讓睡覺。上銬的姿勢五花八門，怎麼難受怎麼來。如一手在上，一手在下，身子不能直立，但值班人員非要讓你站直，並不許動；或在背後加張小板凳，不許動，身體呈弓形，值班人員取笑為擺造型。這種吊銬，不出十分鐘，兩手皆呈麻木狀。下銬後很長一段時間，何兩手都不能用重力，其中一隻手幾乎全無知覺、麻木。當時並因長期戴銬造成兩手腕處有寬約一寸左右的傷痕，傷及到骨。何應清因堅持煉功，被惡警用電棍整整電了一天，致使她兩手臂全是黑紫色，惡警怕出人命才停止。從2003年6月開始，她開始絕食抗議對她的迫害，直到2004年被釋放。儘管她在勞教所遭受如此殘酷的迫害，她仍然堅定對大法的信仰，並以寬容、慈善之心對待周圍的人。
然而從勞教所獲釋並不代表迫害的結束，現在她又被軟禁在學院內的一所平房內，學院專門派幾人對她進行全天「監護」，不能回家與年僅13歲、分別已近四年的女兒團聚。原因是惡人害怕她恢復自由後進京上訪或外出講真象，他們還威脅要將她送入「更高一級的洗腦班」。
從99年至今，由610系統導演，湖南生物機電職業技術學院（原長沙農校）參與、配合的對何應清的迫害已持續了整整四個多年頭了，而這種迫害目前還在延續著，在一位母親與孩子間上演著「咫尺天涯」的悲劇。在此，我們呼籲所有有良知的人給予何應清支持與幫助，共同抵制這種對善良人的無端迫害，使她早獲自由，和親人團聚，回到她所熱愛的講台。
參與迫害何應清的人員：（湖南省長沙市電話號碼區號為0731）
長沙市芙蓉區610辦公室：4303327或4417742
王陽春：13308488095 現芙蓉區政法委副書記，芙蓉區610辦主任
李增欣：13055185126 芙蓉區610辦副主任
趙昌海：13907481325 原芙蓉區政法委副書記，現仍積極參與對大法弟子的迫害
長沙市公安局芙蓉區分局政保科：4783078或4783079 （迫害芙蓉區大法弟子的主要部門）（寄信：長沙市公安局芙蓉區分局 郵編：410001）
湖南生物機電職業技術學院（）：
院領導：胡述光 4637021（辦） 5524419（宅）
方向陽 4637118（辦） 4615698（宅）
曹太益 4637017（辦） 4636678（宅） 手機13875813208 此人是迫害學院內大法弟子的主要責任人
保衛處：
劉正輝 4637110（辦） 4615713（宅） 13808491322
王才用 4637110（辦） 4636789（宅） 13907489459
（寄信：長沙市芙蓉區東湖 湖南生物機電職業技術學院 ，郵編：410127）