中醫根據五行的特性，來描述五臟的某些生理特性和功能作用。如木性可曲可直，條順而暢達，肝屬木，其特點是喜條達而惡抑鬱，並有疏洩之功能；火性溫佑而炎上，心屬火，其特點是心陽有溫煦之功能，心火易於上炎；土性敦厚，有生化萬物之特性，脾屬土，其特點是有消化水谷，運輸精微，營養五臟六腑、四肢百骸的功能，又為氣血生化之源；金性清肅收斂，肺屬金，其特點是具有清宣肅降之功能；水性潤下，有下行、閉藏之性，腎屬水，其特點是主水液代謝之蒸化排泄，並有藏精功能。
五行說認為，五行之間存在著生、克、乘、侮的關係。相生即相互資生和相互助長。五行相生的次序是：木生火，火生土，土生金，金生水，水生木。相剋即相互制約和約束。五行的相剋次序為：木克土，土克水，水克火，火克金，金克木。如果五行相生相剋太過或不及，就會破壞正常的生克關係，而出現相乘或相侮的情況。相乘，即五行中的某一行對被克的一行克制太過。比如，木過於亢盛，而金又不能正常地克制木時，木就會過度地克土，使土更虛，這就是木乘土。相侮，即五行中的某一行本身太過，使克它的一行無法制約它，反而被它所克制，所以又被稱為反克或反侮。比如，在正常情況下水克火，但當水太少或火過盛時，水不但不能克火，反而會被火燒乾，即火反克或反侮水。相生相剋是密不可分的，沒有生，事物就無法發生和生長；而沒有克，事物無所約束，就無法維持正常的協調關係。只有保持相生相剋的動態平衡，才能使事物正常的發生與發展。
相生相剋的關係在中醫中被廣泛應用於解釋五臟之間的關係，臟腑間的病理影響，和相應的診斷和治療。
五臟之間相互資生的關係，可用五行相生來闡明。如腎（水）藏精，肝（木）藏血，腎精可化生肝血，此即腎水滋養肝木，即水生木；肝（木）藏血，心（火）主血脈，肝之貯藏血液和調節血量功能正常，則有助於心主血脈功能的正常發揮，此即肝木上濟心火，即木生火；心（火）主血脈，又主神志，脾（土）主運化，為氣血生化之源，又主統血，心之陽熱可以溫運脾陽，心主血脈功能正常，血能榮脾，脾才能發揮主運化、生血、統血之功能，此即心火溫脾土，即火生土；脾（土）能轉輸精微，益氣以充肺（金），從而維持肺主氣之功能，此為脾氣生養肺氣，即土生金；肺（土）主氣，職司清肅，腎（水）主藏精納氣，肺氣肅降則有助於腎精之閉藏和氣之攝納，肺氣肅降，水道通調，又能促進腎主水功能的發揮，此即肺金滋養腎水，即金生水。
同樣，五行相剋的關係也用於五臟間相互制約的關係。如肺（金）氣清肅下降，氣機調暢，可以抑制肝（木）陽上亢，此即金克木；肝（木）的條達，可以疏洩脾（土）的壅滯，此即木克土；脾（土）的運化，可以制止腎（水）的泛濫，此即土克水；腎（水）的滋潤，可以防止心火的亢烈，此即水克火；心（火）的陽熱，可以制約肺（金）清肅的太過，此即火克金。
五行生克也用於解釋臟腑間的病理影響。如肝病可以傳脾，是木乘土；脾病也可以影響肝，是土侮木；肝脾同病互相影響，即木鬱土虛或土壅木鬱；肝病還可以影響心，為母病及子；影響肺，為木侮金；影響腎，為子病及母。其他臟腑病變也是如此，都可以用五行生克乘侮的關係，說明這些在病理上相互影響。
中醫根據五行說來指導臨床診斷和治療。如木克土，聯繫五臟，肝屬木，脾屬土，那麼肝就可以抑制脾，治脾往往肝脾共治，因而有「扶土抑木」的原則。再如，肝色屬青，味屬酸，如有面色發青，喜食酸味等見症，一般可診斷肝經受病。像這樣的例子很多，不勝枚舉。總的說來中醫無論在診病、辯證、治療、用藥等各方面，都離不開五行說的。
五行生克關係，也用於精神對五臟功能的影響。《素問》說：「怒傷肝，悲勝怒」；「喜傷心，恐勝喜」；「思傷脾，怒勝思」；「憂傷肺，喜勝憂」；「恐傷腎，思勝恐」等，即是運用五行相剋關係來調整情志，從而治療精神性病症。
人體是一個小宇宙，五臟之間就是相互資生、相互制約的，共同維持整體的內環境穩定狀態，五行說以相生相剋論述五臟之間相互聯繫和協調平衡關係。當五臟之間正常的生克制化調節受到破壞，就會出現相乘相侮的現象，就是病理狀態。在臨床，用五行生克乘侮規律不僅能說明疾病的傳變，了解病情的預後；而且能調理各臟腑功能，做出相應的診斷和治療。
傳統中醫不僅認為人體自身是一個整體，是一個小宇宙，它還認為人體的五臟六腑、五體、五官等與自然界的五方、四季、五味等有相應的關係，這樣就把人體與自然環境統一起來，反映了人體與宇宙之間的相互收受通應關係，恰好體現了「天人合一」觀。如春應於東方，風氣主令，故氣候溫和，陽氣生發，萬物滋生，人體之肝氣與之相應，故肝氣旺於春。
此外，關於人體與外界環境，如四時、五氣，以及飲食五味的關係，中醫學亦是用五行之規律來加以說明的，在此不一一列舉說明。